Zera Metan is niet van één kerk, en ook niet voor één kerk. De stichting dient de kerk. In de praktijk werken we nauw samen met gemeenten ter plaatse, onder meer:
Mariano en Mónica dienen Casa de Dios als voorgangers. Piedras Vivas ontstond uit eerder werk in Río Piedras. De samenwerking met De los Andes past bij uitreiken richting het hoogland. Deze gemeenten zijn geen filiaal van de stichting. Zij zijn kerk: prediking, pastoraat, discipelschap, gezinnen. De school en de projecten mogen die gemeenten versterken — met mensen, met toerusting, met praktische hulp — maar nemen hun plaats niet in. Wie vanuit Nederland of elders meekijkt, steunt dus niet “onze kerk”, maar werk dat de plaatselijke gemeente dient en nieuwe werkers toerust.